在公司并购的情况下，股东持有的股份处理方式主要取决于并购协议的内容以及相关法律法规的规定。以下是一些常见的处理方式：
股票转让
记名股票：股东可以通过背书或其他法定方式（如法律、行政法规规定的其他方式）进行转让。转让后，公司需要将受让人的姓名或名称及住所记载于股东名册。
无记名股票：股东可以直接交付股票给受让人，转让即发生效力。
继续持有股票
股东可以选择继续持有股票，并在并购后的公司中按照其持有的股票享有相应的股东权利。
股票回购
被收购的公司可能会通过一定的途径买回本公司发行在外的股份，这是一种大规模改变公司资本结构的方式。股票回购可以采用现金分配或发售债券等方式进行。
协议约定
具体的处理方式还需要参照并购协议中的规定。协议中可能会规定股票的交易方式、比例、价格等细节。
法律依据
股票转让和回购的法律依据主要来源于《中华人民共和国公司法》和《中华人民共和国证券法》。例如，《公司法》第一百二十九条和第一百三十九条分别规定了记名股票和无记名股票的转让方式，而第九十七条和第九十八条涉及被收购公司股权分布不符合上市条件时的处理。
建议
详细审查并购协议：股东应仔细阅读并购协议，了解股票处理的具体条款和条件。
咨询专业律师：在处理股票转让、回购等事宜时，建议咨询专业律师，确保合法合规。
关注市场动态：股票在并购过程中可能会在市场上短暂停牌，股东需关注相关公告和市场动态。
通过以上方式，股东可以更好地了解并处理在公司并购中其持有的股份。
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